More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3075 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3075  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
447 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
561 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 
562 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
567 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
681 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 
572 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 
573 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  42.25 
 
 
688 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
686 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 
688 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  39.79 
 
 
566 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 
563 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
586 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 
565 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.31 
 
 
681 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 
689 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 
558 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
561 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 
558 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  39.42 
 
 
561 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0713  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
685 aa  236  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.862704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 
567 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 
565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 
667 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.79 
 
 
563 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
567 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 
560 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  41.58 
 
 
688 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 
689 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
675 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
568 aa  229  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 
563 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
656 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
566 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
566 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
563 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
587 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  39.47 
 
 
698 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
695 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
561 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
649 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.65 
 
 
561 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 
696 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
561 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 
672 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  37 
 
 
712 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
641 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
563 aa  226  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 
712 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
651 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 
698 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
688 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 
563 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
655 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
563 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 
556 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  41.67 
 
 
691 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
566 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.79 
 
 
542 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
449 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
556 aa  222  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 
711 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 
561 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
563 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 
712 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 
561 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
698 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  41.45 
 
 
707 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  40.34 
 
 
552 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
561 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
694 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.53 
 
 
644 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
561 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
561 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 
649 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2546  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 
649 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389712  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
563 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.67 
 
 
568 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
643 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  40.69 
 
 
675 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
561 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
665 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 
688 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
662 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 
655 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
567 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 
557 aa  216  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 
673 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 
561 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 
651 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4691  chemotaxis sensory transducer  40.97 
 
 
665 aa  216  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  40.85 
 
 
562 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 
564 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
568 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 
563 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
602 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  41.57 
 
 
577 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 
674 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>