More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5156 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
665 aa  1307    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4691  chemotaxis sensory transducer  98.5 
 
 
665 aa  1287    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.94 
 
 
643 aa  1001    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 
649 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2546  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 
649 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389712  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.08 
 
 
665 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.540512  normal  0.0205008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4944  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 
648 aa  425  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000213848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 
573 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  45.63 
 
 
565 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
562 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
688 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
562 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
688 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
694 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 
563 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 
567 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.76 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.64 
 
 
688 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
563 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
656 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
608 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.99 
 
 
675 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
673 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 
688 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.7 
 
 
558 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  46.87 
 
 
565 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  43.73 
 
 
561 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  52.23 
 
 
561 aa  278  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.04 
 
 
656 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
689 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 
561 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
656 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  46.92 
 
 
698 aa  273  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
563 aa  273  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
656 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.02 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
698 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
602 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
566 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 
563 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
672 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 
698 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
561 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.88 
 
 
655 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.8 
 
 
691 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 
561 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 
674 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.67 
 
 
542 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
558 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
558 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
558 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.39 
 
 
563 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  44.13 
 
 
691 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  46.72 
 
 
688 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
564 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
691 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
563 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.44 
 
 
562 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 
563 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
565 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 
563 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
712 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 
563 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  33.48 
 
 
669 aa  260  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 
567 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
674 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
568 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0370  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.01 
 
 
560 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 
563 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 
670 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
563 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
562 aa  257  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  47.26 
 
 
707 aa  257  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 
562 aa  257  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 
563 aa  257  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.88 
 
 
676 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  45.63 
 
 
552 aa  256  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 
562 aa  256  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0245477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.63 
 
 
711 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.91 
 
 
564 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315031  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
556 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
663 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
563 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.88 
 
 
697 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
556 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4669  chemotaxis sensory transducer  47.91 
 
 
564 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
566 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
686 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
563 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
561 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0541  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  32.25 
 
 
687 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
567 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  37.25 
 
 
682 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
566 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.87 
 
 
563 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>