More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4944 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4944  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
648 aa  1248    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000213848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2546  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.95 
 
 
649 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389712  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.95 
 
 
649 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4691  chemotaxis sensory transducer  48.93 
 
 
665 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.24 
 
 
665 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 
643 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.38 
 
 
665 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.540512  normal  0.0205008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 
562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 
563 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  46.52 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
563 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
562 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
694 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.08 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 
567 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.82 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
563 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  44.3 
 
 
565 aa  271  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
573 aa  270  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  46.38 
 
 
669 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  43.83 
 
 
566 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
564 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  46.11 
 
 
565 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 
608 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  44.5 
 
 
712 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  40.76 
 
 
688 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 
656 aa  265  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
688 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.01 
 
 
558 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 
711 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
563 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
563 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  44.99 
 
 
561 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.07 
 
 
566 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
563 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 
562 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
563 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 
563 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
563 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 
558 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
563 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 
688 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
688 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.29 
 
 
663 aa  260  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.7 
 
 
691 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
561 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 
577 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
562 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 
691 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
675 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
561 aa  257  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
563 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
562 aa  256  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
674 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.27 
 
 
561 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.09 
 
 
542 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.58 
 
 
561 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.78 
 
 
695 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
690 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 
568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 
563 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.8 
 
 
556 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
562 aa  253  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
689 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
564 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315031  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 
556 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 
568 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
696 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
559 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4669  chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
564 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 
563 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 
563 aa  251  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
567 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
561 aa  250  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
566 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  48.25 
 
 
558 aa  250  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
563 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
656 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.25 
 
 
558 aa  249  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 
698 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 
673 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
567 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  43.54 
 
 
682 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
656 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 
698 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
672 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 
579 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.33 
 
 
697 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
566 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
602 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2757  chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
591 aa  243  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
560 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
563 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
561 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
644 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  42.65 
 
 
688 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
655 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  45.2 
 
 
552 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0713  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
685 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.862704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>