106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0763 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  97.62 
 
 		 1259 aa  2408    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  80.95 
 
 		 1259 aa  1982    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  79.72 
 
 		 1285 aa  1961    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  82.26 
 
 		 1268 aa  2042    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1254 aa  2488    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  80.72 
 
 		 1269 aa  1965    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  41.87 
 
 		 1012 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  45.35 
 
 		 950 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  42.95 
 
 		 1108 aa  356  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  43.37 
 
 		 1571 aa  346  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  40.66 
 
 		 2578 aa  340  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  42.95 
 
 		 3415 aa  340  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  42.03 
 
 		 2926 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  43.38 
 
 		 3420 aa  337  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  40.66 
 
 		 2906 aa  337  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  40.66 
 
 		 1861 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  38.67 
 
 		 1113 aa  315  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  33.11 
 
 		 1068 aa  308  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  38.93 
 
 		 1593 aa  303  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  38.72 
 
 		 861 aa  149  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  30.45 
 
 		 1349 aa  139  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  30.45 
 
 		 1327 aa  137  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  30.45 
 
 		 1327 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.16 
 
 		 1099 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.75 
 
 		 1806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.22 
 
 		 1327 aa  116  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.08 
 
 		 989 aa  112  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  31.12 
 
 		 1067 aa  113  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1165 aa  111  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1165 aa  111  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  30.79 
 
 		 1070 aa  110  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  29.9 
 
 		 466 aa  110  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.41 
 
 		 947 aa  109  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  30.03 
 
 		 1070 aa  108  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  30.62 
 
 		 773 aa  108  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.31 
 
 		 1040 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 		 1579 aa  107  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.87 
 
 		 1753 aa  107  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.36 
 
 		 1748 aa  107  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.1 
 
 		 1594 aa  104  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.75 
 
 		 1115 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 1770 aa  103  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.77 
 
 		 1762 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.77 
 
 		 1762 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.71 
 
 		 1763 aa  102  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.48 
 
 		 1770 aa  101  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.75 
 
 		 4391 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.41 
 
 		 1093 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.41 
 
 		 1093 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  25.53 
 
 		 1102 aa  99  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.75 
 
 		 4312 aa  98.6  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.18 
 
 		 2637 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.4 
 
 		 868 aa  96.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.95 
 
 		 1357 aa  87.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  26.55 
 
 		 1250 aa  87.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.36 
 
 		 1626 aa  85.5  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.85 
 
 		 1741 aa  82  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.53 
 
 		 1277 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  30.46 
 
 		 997 aa  78.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  30.46 
 
 		 1004 aa  78.2  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.17 
 
 		 820 aa  77.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  27.67 
 
 		 1234 aa  75.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.5 
 
 		 1086 aa  75.1  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.17 
 
 		 909 aa  73.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.18 
 
 		 825 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  43.07 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  43.07 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.99 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26 
 
 		 924 aa  70.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 		 819 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  41.88 
 
 		 2057 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.94 
 
 		 1023 aa  68.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  33.91 
 
 		 818 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  32.82 
 
 		 1234 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.82 
 
 		 1234 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  32.82 
 
 		 1234 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  32.44 
 
 		 1252 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  33.94 
 
 		 1254 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  38.33 
 
 		 3322 aa  65.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.68 
 
 		 1250 aa  65.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.79 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  40.54 
 
 		 955 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  40.54 
 
 		 955 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.3 
 
 		 1055 aa  62  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  26.09 
 
 		 1049 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  25.06 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  36.57 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  25.06 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.09 
 
 		 1197 aa  57  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  39.02 
 
 		 914 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  25.72 
 
 		 1971 aa  55.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.7 
 
 		 995 aa  53.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  24.67 
 
 		 769 aa  52  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.07 
 
 		 638 aa  51.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  26.84 
 
 		 948 aa  51.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  27 
 
 		 948 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  27.06 
 
 		 949 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.92 
 
 		 1122 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.07 
 
 		 638 aa  50.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>