More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1695 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 577 aa  1142    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  76.86 
 
 		 373 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  74.38 
 
 		 380 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  69.31 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  53.32 
 
 		 519 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  72.16 
 
 		 366 aa  505  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  72.24 
 
 		 370 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  66.76 
 
 		 363 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  47.06 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  64.03 
 
 		 370 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  44.58 
 
 		 560 aa  455  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  64.32 
 
 		 363 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  65.16 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  61.52 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  60.38 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  61.98 
 
 		 358 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  60.88 
 
 		 358 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  60.06 
 
 		 368 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  58.7 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  61.37 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  59.32 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  58.95 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  60.55 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  58.27 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  56.83 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  58.52 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 371 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  61.33 
 
 		 360 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  61.33 
 
 		 360 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  61.33 
 
 		 360 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  58.02 
 
 		 366 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  57.73 
 
 		 357 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  56.75 
 
 		 357 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 593 aa  339  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  55.68 
 
 		 361 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  54.57 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.53 
 
 		 539 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 		 591 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.3 
 
 		 604 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.3 
 
 		 579 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.25 
 
 		 593 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  42.12 
 
 		 376 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 372 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  69.88 
 
 		 188 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  34.02 
 
 		 615 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  34.42 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 371 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  37.84 
 
 		 368 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 366 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  66.27 
 
 		 187 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  35.45 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 359 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  36.88 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  64.02 
 
 		 181 aa  213  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  35.34 
 
 		 363 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 372 aa  213  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 362 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.25 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 370 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  33.23 
 
 		 359 aa  211  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 372 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 370 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 363 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 		 367 aa  210  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 351 aa  209  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 367 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 364 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40.54 
 
 		 377 aa  208  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 366 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 351 aa  207  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 349 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 355 aa  206  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 361 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 345 aa  206  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 351 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  38.52 
 
 		 368 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 388 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 		 364 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  36.65 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 361 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 		 363 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 359 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.21 
 
 		 362 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  34.62 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  34.91 
 
 		 363 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  37.94 
 
 		 352 aa  203  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  43.11 
 
 		 385 aa  203  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>