More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1307 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 361 aa  699    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  59.66 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  60.34 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  58.71 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  59.55 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  56.87 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  58.17 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  58.01 
 
 		 357 aa  362  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  58.33 
 
 		 357 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 371 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  59.65 
 
 		 366 aa  361  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  57.3 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 359 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  54.67 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  57.53 
 
 		 577 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 380 aa  355  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  55.71 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  53.04 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  55.87 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  53.35 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  53.04 
 
 		 363 aa  342  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  53.45 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  53.37 
 
 		 519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  57.67 
 
 		 360 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  57.67 
 
 		 360 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  57.67 
 
 		 360 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  53.01 
 
 		 389 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  57.02 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  47.5 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  47.62 
 
 		 560 aa  301  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 593 aa  279  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.12 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 359 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 359 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 359 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.53 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.26 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.49 
 
 		 359 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  44.24 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.19 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  44.15 
 
 		 539 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  38.37 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 368 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  42.57 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  32.77 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  32.49 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  36.27 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  38 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>