More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2327 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  77.32 
 
 		 371 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  73.91 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  72.22 
 
 		 362 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  73.39 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  75.14 
 
 		 360 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  73.91 
 
 		 368 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  75.14 
 
 		 360 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  72.27 
 
 		 359 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  75.14 
 
 		 360 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  68.98 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  61.04 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.57 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  60.74 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  61.32 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  55.76 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  60.22 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  58.7 
 
 		 577 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  56.1 
 
 		 380 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  59.88 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  56.53 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  55.37 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  57.51 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  57.51 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  55.68 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  56.82 
 
 		 358 aa  362  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  53.13 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  51.51 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  54.62 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  52.54 
 
 		 519 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  48.87 
 
 		 540 aa  323  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  48.34 
 
 		 560 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  54.91 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 363 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  45.65 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  37.72 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 364 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 359 aa  229  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  39.42 
 
 		 361 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.42 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 359 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  39.67 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  41.05 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.7 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  43.11 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 		 359 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.71 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 359 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  34.9 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.63 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.66 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 367 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  41.07 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  42 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>