More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3151 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 353 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  58.64 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  56.5 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  56.09 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  57.39 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  57.02 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 358 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  59.21 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  57.68 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  54.78 
 
 		 368 aa  348  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  54.57 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  59.01 
 
 		 366 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  56.09 
 
 		 370 aa  342  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  57.58 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  54.36 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  57.39 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  54.91 
 
 		 368 aa  335  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  52.2 
 
 		 395 aa  335  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  55.36 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  54.02 
 
 		 577 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  55.23 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  51.13 
 
 		 540 aa  325  7e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  53.28 
 
 		 359 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  52.37 
 
 		 519 aa  325  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  53.56 
 
 		 359 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  50.69 
 
 		 380 aa  322  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  50.57 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  52.54 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  53.28 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  53.49 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  50.84 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  55.04 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  55.04 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  55.04 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 		 560 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 593 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  42.48 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  43.24 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.06 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  32.68 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  32.39 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.79 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.05 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  33.24 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  32.39 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.79 
 
 		 364 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  40.16 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  35.78 
 
 		 353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.95 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  35.84 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 358 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.51 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.07 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.58 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>