More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0878 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  75.49 
 
 		 368 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  70.95 
 
 		 358 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  70.03 
 
 		 358 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  68.99 
 
 		 358 aa  471  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  62.85 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  63.31 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  60.57 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  58.57 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  61.76 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  61.02 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  57.03 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  60.29 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  59.77 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  58.36 
 
 		 577 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  57.82 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  58.79 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  57.87 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  54.62 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  55.08 
 
 		 371 aa  359  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 		 359 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  57.91 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  57.02 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  56.73 
 
 		 519 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  54.11 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  59.51 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  59.51 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  59.51 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 540 aa  340  2e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  59.01 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  49.03 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 593 aa  266  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  45.6 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  36.76 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  34.1 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.61 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 359 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.19 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  36.28 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.8 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  35.67 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  37.16 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0434  3-dehydroquinate synthase  40.52 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 539 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  35.55 
 
 		 366 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  35.55 
 
 		 366 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  34.23 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  34.64 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  33.74 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  34.97 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  36.74 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  34.99 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  33.63 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  37.4 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  34.96 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 354 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 364 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  33.43 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  37.28 
 
 		 363 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  33.15 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  33.99 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  36.73 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  38.38 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  34.38 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  37.17 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  38.66 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1459  3-dehydroquinate synthase  46.34 
 
 		 352 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.066211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>