More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1732 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1329  3-dehydroquinate synthase  48.68 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.160961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2746  3-dehydroquinate synthase  45.97 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.213774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  45.88 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  46.25 
 
 		 519 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 560 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1459  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 352 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.066211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  43.88 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 577 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  41.85 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  43.03 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  42.56 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1035  3-dehydroquinate synthase  33.23 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4556  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 361 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  37.98 
 
 		 366 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  42.44 
 
 		 539 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 375 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  36.2 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  30.88 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  30.88 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 374 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  36.72 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  36.72 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  37.17 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  34.72 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  35.53 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  35.49 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  37.16 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1524  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1553  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.559547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  30.59 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  36.74 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  43.31 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.95 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  42.91 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 361 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  32.96 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  37.2 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  37.31 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  36.82 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  35.28 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  34.94 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  36.04 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  36.95 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.66 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>