More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3533 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 360 aa  734    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 368 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 359 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.43 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.4 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  40.65 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.25 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  37.97 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  39.76 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  39.7 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  37.09 
 
 		 431 aa  247  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 369 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.38 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  35.88 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  39.4 
 
 		 359 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  40.66 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  39.87 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  37.98 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.45 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  38.37 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  37.79 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  37.84 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  39.76 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  43 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 359 aa  235  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  35.49 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.14 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  38.9 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  37.88 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  39.4 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>