More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2951 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
358 aa  700    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  73.95 
 
 
358 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  69.55 
 
 
368 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  69.75 
 
 
358 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  64.15 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  68.99 
 
 
366 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  62.53 
 
 
373 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  59.05 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  61.8 
 
 
370 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  62.32 
 
 
366 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  59.49 
 
 
368 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  58.94 
 
 
363 aa  391  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  62.54 
 
 
357 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  57.94 
 
 
395 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  59.42 
 
 
389 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  60.45 
 
 
357 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  58.95 
 
 
577 aa  381  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  58.5 
 
 
380 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  56.53 
 
 
368 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  58.55 
 
 
368 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  59.66 
 
 
361 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  56.67 
 
 
371 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  58.91 
 
 
362 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  55.37 
 
 
371 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 
359 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 
359 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  56.35 
 
 
365 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 
362 aa  361  8e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  53.48 
 
 
360 aa  352  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  59.12 
 
 
360 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  59.12 
 
 
360 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  59.12 
 
 
360 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  56.09 
 
 
353 aa  338  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 
519 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  48.37 
 
 
560 aa  332  5e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  47.95 
 
 
540 aa  328  8e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 
593 aa  259  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 
363 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 
368 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 
360 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 
362 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.37 
 
 
361 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.95 
 
 
361 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 
366 aa  222  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  40.53 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  33.71 
 
 
353 aa  219  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 
371 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 
362 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 
363 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 
359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.62 
 
 
368 aa  215  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  34.12 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  36.66 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 
350 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  33.53 
 
 
363 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 
362 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 
350 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  43.2 
 
 
367 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 
388 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  32.95 
 
 
354 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 
370 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  43.08 
 
 
363 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40.13 
 
 
539 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 
370 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.41 
 
 
370 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1664  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 
364 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.825748  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  32.94 
 
 
356 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 
368 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  39.65 
 
 
377 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 
370 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 
359 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 
368 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 
363 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 
366 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 
368 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 
365 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  35.63 
 
 
368 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 
371 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 
365 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 
376 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 
367 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 
360 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 
351 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 
367 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0434  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 
356 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 
368 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 
352 aa  205  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.59 
 
 
345 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 
376 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  37.84 
 
 
369 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 
370 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 
365 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 
368 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 
351 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 
385 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>