More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1835 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 373 aa  737    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  76.86 
 
 		 577 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  71.54 
 
 		 380 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  75.07 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  73.2 
 
 		 370 aa  504  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  69.89 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  64.38 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  63.49 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  63.29 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  62.02 
 
 		 389 aa  434  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  60.64 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  61.45 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  60.63 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  62.53 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  61.8 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  55.76 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  60.17 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  58.82 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  59.79 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  56.68 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  58.84 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  59.1 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  58.29 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  59.12 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  57.57 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  58.29 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  56.86 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 519 aa  362  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  60.57 
 
 		 366 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  51.97 
 
 		 540 aa  354  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  56.87 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 560 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 593 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.25 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.25 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.79 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  42.44 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.6 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 364 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  32.85 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  35.76 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  39.69 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.73 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  38.61 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  32.75 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  34.97 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  34.86 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  31.87 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  40.05 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.45 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 354 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  34.51 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  37.19 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  35.74 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  35.74 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  39.5 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  34.03 
 
 		 353 aa  202  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  36.5 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>