More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2616 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 371 aa  736    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  77.32 
 
 		 368 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  73.22 
 
 		 368 aa  534  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 362 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 359 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  71.07 
 
 		 359 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  74.22 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  74.22 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  74.22 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  71.04 
 
 		 368 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  69.25 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  60.43 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  60.38 
 
 		 577 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  60.67 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  60.17 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  56.65 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  59.94 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  56.68 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  59.6 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  56.22 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  59.71 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  55.65 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  57.67 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  54.65 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  58.07 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  55.91 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  55.65 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 361 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  55.08 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  52.1 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 519 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  47.71 
 
 		 540 aa  321  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  47.45 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  50.57 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 593 aa  278  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 372 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  45.13 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 372 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 388 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  44.7 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  44.06 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 361 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.19 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  39.7 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  43.19 
 
 		 359 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 368 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 		 359 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 		 361 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  40.89 
 
 		 360 aa  222  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.52 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  45.49 
 
 		 368 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  36.64 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  45.08 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  36.52 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  39.23 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.51 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  41.84 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>