More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3207 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 362 aa  705    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  77.84 
 
 		 371 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  59.77 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  59.33 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  60.49 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  60.4 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  59.1 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  60.69 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  55.37 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  59.88 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.03 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  58.82 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  54.65 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  56.83 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  57.68 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  58 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  57.97 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  56.25 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  56.86 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 358 aa  361  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  58.05 
 
 		 362 aa  361  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  55.99 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  56.02 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  58.05 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  58.05 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  58.05 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  57.87 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  56 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  55.31 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  53.63 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  57.68 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  51.55 
 
 		 519 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  50.29 
 
 		 365 aa  308  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 560 aa  290  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 593 aa  242  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.38 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  44.7 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.66 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  38.25 
 
 		 364 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  34.73 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.36 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  35.85 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 359 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  39.63 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 359 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  34.73 
 
 		 363 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  36.04 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 370 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  42.4 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.15 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.45 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 376 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>