More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2647 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  94.41 
 
 		 359 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  83.05 
 
 		 362 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  87.64 
 
 		 360 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  87.64 
 
 		 360 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  87.64 
 
 		 360 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  73.39 
 
 		 368 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 		 371 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  72.83 
 
 		 368 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  69.91 
 
 		 368 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  66.85 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  61.28 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.22 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  59.67 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  61.34 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  61.41 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  58.29 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  60.98 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  59.88 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  59.73 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  60.17 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  57.97 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  57.43 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  58.6 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  56.63 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  57.02 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  51.69 
 
 		 519 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  51.54 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  53.56 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  46.43 
 
 		 560 aa  301  9e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  47.67 
 
 		 593 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 361 aa  246  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 370 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 363 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  38.68 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 359 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  35.8 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  46.5 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 361 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.77 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 359 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 359 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.63 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.11 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.05 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.28 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  40.66 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.27 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  43.81 
 
 		 365 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.81 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  38.73 
 
 		 361 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>