More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 593 aa  1161    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 560 aa  329  7e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  39.11 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 		 362 aa  277  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 370 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  47.12 
 
 		 359 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 371 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  47.67 
 
 		 359 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 368 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  49.85 
 
 		 360 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  46.85 
 
 		 368 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 373 aa  267  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  50.61 
 
 		 360 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  50.61 
 
 		 360 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  50.61 
 
 		 360 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 371 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  46.03 
 
 		 370 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  47.93 
 
 		 380 aa  260  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 368 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 358 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 358 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  49.16 
 
 		 361 aa  257  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  48.03 
 
 		 366 aa  256  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 389 aa  255  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  45.5 
 
 		 395 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  47.75 
 
 		 357 aa  252  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  45.73 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 353 aa  250  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  46.43 
 
 		 371 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 366 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  47.01 
 
 		 357 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  45.24 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 362 aa  242  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 		 594 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.38 
 
 		 539 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.32 
 
 		 367 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 363 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 368 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 363 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 		 604 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.68 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 363 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.46 
 
 		 359 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  35.74 
 
 		 363 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  34.9 
 
 		 363 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 		 593 aa  212  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  35.02 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  35.95 
 
 		 579 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  37.72 
 
 		 363 aa  207  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 368 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 375 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 370 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 		 361 aa  205  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 371 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.39 
 
 		 369 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 377 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 361 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  35.81 
 
 		 552 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  36.19 
 
 		 360 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.7 
 
 		 362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 366 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 369 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 370 aa  198  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 368 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.04 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  37.73 
 
 		 351 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 385 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 351 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 		 359 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  36.19 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 370 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  35.54 
 
 		 360 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 366 aa  193  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.57 
 
 		 361 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4556  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 369 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0434  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.72 
 
 		 361 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  40.89 
 
 		 348 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  40.3 
 
 		 371 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>