More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4556 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4556  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 361 aa  719    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 364 aa  278  9e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  44.57 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  43.92 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 369 aa  275  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 388 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  46.39 
 
 		 368 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.25 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  48.17 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  43.68 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 368 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  48.17 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  46.46 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.56 
 
 		 374 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  48.6 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  46.34 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  46.48 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  44.93 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  46.87 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.34 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  44.79 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  42.16 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  46.98 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.27 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  44.57 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  46.69 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  47.67 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  46.96 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  47.4 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  46.22 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.47 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  47.61 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  46.48 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  39.95 
 
 		 367 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.78 
 
 		 358 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 382 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.65 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>