More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3058 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 532 aa  1050    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.01 
 
 		 593 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  38.75 
 
 		 591 aa  253  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  38.74 
 
 		 579 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 		 519 aa  240  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.09 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.09 
 
 		 604 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  35.78 
 
 		 540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 552 aa  229  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.26 
 
 		 594 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.88 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 369 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  36.5 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 356 aa  217  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  35.25 
 
 		 577 aa  216  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.24 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 368 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 368 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  40.8 
 
 		 368 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 364 aa  214  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  38.75 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  39.81 
 
 		 360 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 352 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 359 aa  210  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  41.77 
 
 		 368 aa  210  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  44.15 
 
 		 354 aa  210  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.28 
 
 		 361 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 358 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 361 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.59 
 
 		 362 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  44.37 
 
 		 361 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  42.95 
 
 		 350 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 373 aa  207  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  36.71 
 
 		 358 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  35.61 
 
 		 359 aa  207  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  38.99 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 361 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 369 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 		 359 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  40.13 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  37.97 
 
 		 359 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 360 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 354 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  35.81 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 359 aa  204  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 370 aa  203  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.91 
 
 		 359 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 358 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.43 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  37.81 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  27.63 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 359 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 359 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 359 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 366 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 366 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 359 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 361 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 359 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 362 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>