More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2021 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 370 aa  725    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  73.2 
 
 		 373 aa  521  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  72.24 
 
 		 577 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  68.73 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  73.65 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  70.88 
 
 		 380 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  70.77 
 
 		 363 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  69.08 
 
 		 370 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  70.77 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  65.41 
 
 		 368 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  67.5 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  67.61 
 
 		 368 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  65.9 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 371 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  62.57 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  62.33 
 
 		 359 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  62.46 
 
 		 358 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  62.67 
 
 		 371 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  62.25 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  64.29 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  63.48 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  61.8 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  62.22 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  61.73 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  62.61 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  65.31 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  65.31 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  65.31 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  60.89 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  63.31 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  60.61 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  56.51 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  50.55 
 
 		 540 aa  354  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 519 aa  346  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 361 aa  346  5e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  47.07 
 
 		 560 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  56.09 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 593 aa  266  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 372 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  42.3 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.11 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  36.63 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  46.83 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 362 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.28 
 
 		 364 aa  218  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  42.07 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  34.18 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  43.4 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.8 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.66 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 367 aa  212  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  33.54 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  34.47 
 
 		 354 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.98 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.07 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 359 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 359 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 358 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.66 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>