More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 395 aa  781    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  80.27 
 
 		 380 aa  565  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  69.89 
 
 		 373 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  69.31 
 
 		 577 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  68.73 
 
 		 370 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  66.58 
 
 		 366 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  63.2 
 
 		 363 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  61.99 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  63.76 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  61.82 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  58.87 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  60.16 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  56.38 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  55.76 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  59.67 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  57.94 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  57.94 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  57.66 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  57.85 
 
 		 362 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  56.5 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  54.96 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  55.05 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  61.96 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  61.96 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  61.96 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  55.28 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  52.69 
 
 		 540 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  52.92 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  53.48 
 
 		 357 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  51.44 
 
 		 560 aa  332  6e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  49.48 
 
 		 519 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  54.67 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  52.2 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  45.75 
 
 		 593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.45 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  39.73 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  37.93 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  37.06 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  38.58 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 363 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  37.07 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.98 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.3 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.37 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  33.53 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  35.34 
 
 		 353 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  33.83 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  38.28 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.25 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.79 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  36.02 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  36.89 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 368 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  38.28 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 349 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 370 aa  209  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 351 aa  209  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 		 368 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  35.78 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 		 352 aa  208  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  34.17 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 359 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  34.6 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>