More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4296 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 371 aa  732    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  73.41 
 
 		 368 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  68.98 
 
 		 368 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  68.98 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  70.11 
 
 		 368 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  66.85 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  65.17 
 
 		 362 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  68.06 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  66.3 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  68.06 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  68.06 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  60.65 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  63.97 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.67 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  58.82 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  59.71 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  55.05 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  59.71 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  56.68 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  57.5 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  56.25 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  56.57 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  57.98 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  58.91 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  54.96 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  54.32 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  55.87 
 
 		 361 aa  342  9e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  54.11 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  50.97 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 519 aa  325  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 540 aa  314  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  45.75 
 
 		 560 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  52.53 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  46.43 
 
 		 593 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  45.91 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.48 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40.6 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  44.59 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.91 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 359 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 		 359 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 		 359 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  35.86 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.96 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  44.14 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.83 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  36.47 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 351 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>