More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1847 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 357 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  89.61 
 
 		 357 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  62.54 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  61.41 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  59.12 
 
 		 373 aa  401  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  60.45 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  59.94 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  62.89 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  61.02 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  60.89 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  60.58 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  58.64 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  61.63 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  57.79 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  57.42 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  57.91 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  61.76 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  59.31 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  57.85 
 
 		 577 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  55.96 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  53.48 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  54.42 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  56.58 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  57.78 
 
 		 361 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  57.18 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  57.71 
 
 		 362 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  56.29 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  56 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  59.87 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  59.87 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  59.87 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  53.87 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  57.39 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 540 aa  324  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  45.62 
 
 		 560 aa  309  4e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  47.01 
 
 		 593 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.05 
 
 		 359 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  33.53 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  36.46 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  33.53 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  33.61 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 361 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  33.23 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.98 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  34.15 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  33.53 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  39.95 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.38 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  31.23 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  38.67 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  38.96 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  36.88 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 367 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>