More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2009 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 363 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  92.01 
 
 		 363 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  76.67 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  70.17 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  70.77 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  66.3 
 
 		 370 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  64.38 
 
 		 373 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  66.76 
 
 		 577 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  62.36 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  65.45 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  62.18 
 
 		 368 aa  424  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  63.69 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  60.74 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  60.17 
 
 		 371 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  58.94 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  63.34 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  59.05 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  59.72 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  61.63 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  61.34 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  61.74 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  59.71 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  60.4 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  64.29 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  64.29 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  59.5 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  64.29 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  58.04 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  58.99 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  54.14 
 
 		 365 aa  359  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  49.46 
 
 		 560 aa  344  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  53.57 
 
 		 519 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  49.73 
 
 		 540 aa  338  7e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  53.04 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  54.65 
 
 		 353 aa  312  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 593 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.12 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 359 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 364 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  36.95 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  35.63 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 359 aa  229  7e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 362 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.93 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 539 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.65 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  33.52 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  37.17 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.52 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.16 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.9 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40.66 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  36.64 
 
 		 353 aa  223  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.97 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.42 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  40.41 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  39.81 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 368 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.31 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  42.44 
 
 		 360 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.51 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>