More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2395 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
360 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
360 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
360 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  88.48 
 
 
359 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  87.64 
 
 
359 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  83.62 
 
 
362 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  75.14 
 
 
368 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  74.02 
 
 
368 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  74.22 
 
 
371 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  73.35 
 
 
368 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  69.44 
 
 
371 aa  471  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  63.69 
 
 
370 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  63.27 
 
 
363 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.54 
 
 
370 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  60.45 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  58.24 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  62.78 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  61.81 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  60.06 
 
 
577 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  58.62 
 
 
371 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  58.05 
 
 
362 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  61.16 
 
 
380 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  62.1 
 
 
389 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  57.88 
 
 
358 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  58.02 
 
 
360 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  58.96 
 
 
368 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  57.51 
 
 
358 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  59.77 
 
 
357 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  58.14 
 
 
358 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  57.51 
 
 
357 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  58.21 
 
 
366 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  56 
 
 
361 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  52.84 
 
 
365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  52.86 
 
 
519 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  55.04 
 
 
353 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  48.43 
 
 
540 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  49 
 
 
560 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  49.18 
 
 
593 aa  285  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 
368 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 
361 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 
361 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.6 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 
370 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 
366 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  43.6 
 
 
367 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.34 
 
 
363 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 
368 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
368 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.52 
 
 
366 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 
362 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 
359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.08 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 
368 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 
359 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  39.43 
 
 
361 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 
367 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 
367 aa  232  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
374 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 
361 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  41.86 
 
 
388 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 
363 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  36.47 
 
 
363 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 
373 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  39.43 
 
 
361 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  42.43 
 
 
371 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 
356 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 
360 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  40.53 
 
 
360 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 
372 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 
361 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.67 
 
 
368 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  39.42 
 
 
351 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 
368 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 
368 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 
359 aa  228  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 
358 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
366 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.37 
 
 
368 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 
368 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 
359 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>