More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1664 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1664  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 364 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.825748  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0434  3-dehydroquinate synthase  78.59 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1253  3-dehydroquinate synthase  68.24 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  66.76 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1717  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  44.59 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  41.31 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  41.99 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 358 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  36.64 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  35.25 
 
 		 364 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  38.38 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  44.11 
 
 		 540 aa  199  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 366 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  35.35 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  35.8 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  36.53 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  37.16 
 
 		 351 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  34.59 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  35.49 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  35.33 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  35.94 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  35.8 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  36.56 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  36.22 
 
 		 358 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  40.55 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 368 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  38.82 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  36.65 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  38.82 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  37.63 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  40.28 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.14 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  38.01 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  35.17 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  35.9 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  38.34 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 		 358 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  37.19 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  37.47 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 560 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  34.63 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  36.57 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  36.29 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  34.29 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  33.64 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  37.19 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  36.09 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>