More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2548 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 370 aa  736    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05160  3-dehydroquinate synthase  61.25 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  45.71 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  45.9 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 		 362 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 370 aa  268  8e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.64 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  37.74 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  38.02 
 
 		 363 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 350 aa  262  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.79 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 354 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  40.75 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 367 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  46.52 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  46.37 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  43.53 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  43.62 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.57 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  45.72 
 
 		 370 aa  252  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 358 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 362 aa  252  9.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  43.23 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 358 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.23 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  42.43 
 
 		 372 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.11 
 
 		 358 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 		 366 aa  249  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  48.22 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.47 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.4 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 364 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  44.67 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  42.29 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.28 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 552 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 374 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  35.68 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  45.87 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>