More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05160 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05160  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  746    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  61.25 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.45 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.45 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.86 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.84 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.56 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42 
 
 		 367 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.55 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  42.78 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  36.21 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 368 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  42.12 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  36.41 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 591 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 359 aa  238  9e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.55 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1459  3-dehydroquinate synthase  48.1 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.066211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 431 aa  235  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  42.63 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  41.27 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  42.39 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  40.37 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  42.3 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  43.38 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  39.06 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>