More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1553 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1524  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1553  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.559547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1035  3-dehydroquinate synthase  63.28 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  36.71 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  36.21 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  34.4 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  35.13 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  34.58 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  34.51 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  36.74 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  33.42 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  35.95 
 
 		 370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  35.95 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  34.91 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  36.69 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  37.06 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  35.84 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  34.17 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  32.88 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  33.89 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 594 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  34.17 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  35.26 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  32.87 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  35.26 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  35.77 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  33.73 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  35.1 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  35.86 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  35.36 
 
 		 365 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  36.54 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  32.19 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  35.04 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  34.72 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  34.34 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  34.34 
 
 		 552 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  34.3 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  34.08 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  35.19 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  35.54 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  36.12 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  33.92 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  33.92 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  35.08 
 
 		 364 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  35.41 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  34.81 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  33.53 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  35.99 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.14 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  33.73 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1329  3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.160961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  32.96 
 
 		 355 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  32.41 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  33.43 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  35.99 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  34.37 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  34.22 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>