More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1329 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1329  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 351 aa  697    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.160961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2746  3-dehydroquinate synthase  63.82 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.213774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  48.4 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1524  3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1553  3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.559547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  41.01 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1035  3-dehydroquinate synthase  33.04 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  39.43 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 577 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  38.32 
 
 		 362 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  37.95 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  38.9 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  35.16 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 		 540 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 358 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 358 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  34.93 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  35.45 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  34.58 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  35.67 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  34.58 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10210  3-dehydroquinate synthase  36.72 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 361 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  34.36 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  34.45 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  34.29 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  38.98 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1459  3-dehydroquinate synthase  46.21 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.066211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 539 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  32.95 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  35.11 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  39.11 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4556  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  35.45 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  33.62 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  33.99 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  35.9 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  38.02 
 
 		 361 aa  169  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  33.81 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  33.81 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  39.21 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  34 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  32.47 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  33.81 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  34.65 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>