More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2746 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2746  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 350 aa  700    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.213774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1329  3-dehydroquinate synthase  63.82 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.160961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  45.97 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  41.38 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  36.41 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  36.04 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  36.27 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.76 
 
 		 359 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  35.51 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  41.73 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  35.05 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  39.73 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  34.78 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  34.75 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.38 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4556  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  37.12 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  34.45 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1524  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  39.29 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1553  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.559547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  34.47 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  37.19 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 540 aa  176  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.45 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 366 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  43.51 
 
 		 366 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  36.23 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  35.2 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  38.93 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  38.77 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  34.93 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  34.02 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  39.87 
 
 		 519 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.67 
 
 		 539 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  36.46 
 
 		 366 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  37.41 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  38.97 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  36.69 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  35.89 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1459  3-dehydroquinate synthase  41.05 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.066211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  37.06 
 
 		 560 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0208  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  37.94 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  37.05 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  36.3 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  38.95 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  38.77 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.45 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>