More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0208 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0208  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
391 aa  752    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0205078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0199  3-dehydroquinate synthase  78.3 
 
 
387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0210  3-dehydroquinate synthase  78.01 
 
 
384 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.822446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0188  3-dehydroquinate synthase  77.13 
 
 
389 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.575872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  38.91 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  38.3 
 
 
369 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 
361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  38.82 
 
 
358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 
374 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  40.64 
 
 
362 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 
359 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 
366 aa  210  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  39.58 
 
 
362 aa  209  7e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 
359 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  38.07 
 
 
359 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 
367 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  42.52 
 
 
361 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 
359 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  37.31 
 
 
369 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 
359 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 
364 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 
358 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 
366 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 
358 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  33.62 
 
 
366 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 
361 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  33.62 
 
 
366 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
359 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 
358 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 
364 aa  205  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 
358 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 
388 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.31 
 
 
363 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 
369 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 
364 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 
366 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 
431 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 
361 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  38.28 
 
 
356 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  34.12 
 
 
356 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  46.1 
 
 
352 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
362 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
362 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
362 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
362 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
362 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
362 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
358 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  40.94 
 
 
362 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
362 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  36.69 
 
 
359 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  40.64 
 
 
362 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 
358 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 
371 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  40.64 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  32.44 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  36.26 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  40.64 
 
 
362 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  36.92 
 
 
366 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 
359 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 
366 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 
366 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 
363 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
372 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  34.76 
 
 
355 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 
359 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 
362 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 
370 aa  199  9e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 
362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  32.04 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 
362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 
362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  41.84 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 
370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 
370 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  37.28 
 
 
362 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  42.91 
 
 
375 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  47.39 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  31.74 
 
 
363 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 
355 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  36.26 
 
 
346 aa  195  9e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 
368 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 
579 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  31.44 
 
 
363 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 
368 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>