More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1280 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1875  3-dehydroquinate synthase  60.62 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.722069 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0806  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.117722  normal  0.388542 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 341 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  39.73 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.54 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 363 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  37.38 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  37.11 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.94 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  42.8 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  37.11 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  39.48 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 359 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 362 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.12 
 
 		 364 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  37.59 
 
 		 363 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  36.2 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  40.49 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.68 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  38.91 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  36.25 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  37.22 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  35.76 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  38.41 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  35.9 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  36.79 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.23 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  35.84 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 352 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 366 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  39.69 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  34.66 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  36.28 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  37.23 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  37.79 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2494  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  35.82 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.13 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  36.76 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  36.17 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 388 aa  192  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.83 
 
 		 361 aa  193  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  35.85 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 366 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.41 
 
 		 363 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 362 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  37.87 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  36.95 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  36.95 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  37.67 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  34.97 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  34.12 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  35.46 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  37.67 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  35.78 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  37.67 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  38.34 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 		 368 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>