More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1875 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1875  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 348 aa  698    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.722069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  60.62 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0806  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 350 aa  248  8e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.117722  normal  0.388542 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  46.89 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  39.68 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  44.24 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  44.24 
 
 		 367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  41.07 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 358 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.52 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.33 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  38.93 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  39.85 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  38.82 
 
 		 431 aa  205  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  41.54 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  39.75 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  43.36 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41.07 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 364 aa  199  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 363 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  40.3 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  41.84 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0047  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  42.62 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  38.13 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  40.65 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 		 371 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 		 355 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.66 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  40.14 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  38.41 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.4 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  40.66 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  39.21 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  39.21 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  39.57 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  37.93 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  38.82 
 
 		 1611 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.93 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  37.09 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  41.22 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>