More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1941 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 341 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.7 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  43.4 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  41.99 
 
 		 358 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.98 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.99 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.99 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  39.81 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  41.35 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  37.72 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.61 
 
 		 369 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 388 aa  215  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  39.87 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  36.76 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  40.81 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  35.2 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  39.54 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 362 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 339 aa  209  8e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 360 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  37.17 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  36.75 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  39.04 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  38.41 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  35.67 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  36.87 
 
 		 367 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 361 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 365 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  35.2 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  36.09 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  36.44 
 
 		 367 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  38.99 
 
 		 366 aa  205  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 365 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  38.41 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  37.27 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  34.31 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2494  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  33.43 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  37.06 
 
 		 359 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  35.8 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>