More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1585 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  750    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  56.29 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  55.21 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  44.11 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 370 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  38.99 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  42.14 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  41.2 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  35.65 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  38.67 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.25 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  42.12 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  39.25 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  36.16 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  41.07 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  39.57 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  36.75 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  33.52 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  37.34 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  38.23 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  38.73 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  35.28 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  34.93 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.56 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.37 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  38.93 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  36.53 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  37.27 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  35.82 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  35.59 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  38.01 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  38.13 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  36.3 
 
 		 364 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  35.39 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  33.71 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  36.14 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>