More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0718 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 349 aa  713    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  52.8 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  52.52 
 
 		 344 aa  341  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  47.86 
 
 		 355 aa  312  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  43.34 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  43.81 
 
 		 366 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 361 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  34.78 
 
 		 367 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.17 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  40.32 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.75 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  41.56 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  40.27 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  40.19 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.74 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  37.77 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  38.85 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  34.6 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.28 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  41.2 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.56 
 
 		 362 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 		 370 aa  185  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  39.58 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  40.49 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40.2 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.28 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 369 aa  182  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  34.77 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.7 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  36.79 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.16 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  36.45 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.67 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  33.73 
 
 		 593 aa  179  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  36.29 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>