More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3640 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 344 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  68.33 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  52.52 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  45.12 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  36.97 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  38.65 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.73 
 
 		 368 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  39.5 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  36.02 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.71 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.35 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  37.07 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  38.67 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  38.61 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.32 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.81 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.16 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.84 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.17 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  40.26 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.2 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  37.79 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  40.26 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  40.89 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.26 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 367 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.74 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.75 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  39.43 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  38.96 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 359 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  38.99 
 
 		 376 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  37.22 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  38.6 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  39.51 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  39.51 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  38.65 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  39.51 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  35.8 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  34.97 
 
 		 532 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  35.06 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  35.06 
 
 		 370 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  33.74 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  35.65 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  39.21 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>