More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1247 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 353 aa  726    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  38.98 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 355 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  35.81 
 
 		 373 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  35.81 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  33.04 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  37.74 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  34.82 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  34.17 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  35.81 
 
 		 370 aa  165  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  34.95 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  34.15 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  32.81 
 
 		 354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  35.26 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1350  3-dehydroquinate synthase  33.73 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  36.65 
 
 		 370 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  34.94 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  41.78 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  37.8 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  33.74 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  33.74 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  32.54 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  34.03 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  34.14 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  35.33 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  31.16 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  34.84 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  34.02 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  36.22 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  31.82 
 
 		 358 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  37.77 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  31.21 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  32.43 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  30.59 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  38.13 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2746  3-dehydroquinate synthase  34.34 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.213774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  34.42 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  34.88 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  33.47 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  38.71 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  34.84 
 
 		 367 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  33.97 
 
 		 519 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  35.81 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  30.03 
 
 		 359 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  32.26 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  30.32 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1875  3-dehydroquinate synthase  34.49 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.722069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  33.88 
 
 		 1571 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  34.29 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  32.57 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  31.96 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  31.72 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  34.48 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  35.03 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  30.65 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  31.3 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  33.55 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  32.04 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  31.12 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  36.55 
 
 		 354 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  30.14 
 
 		 532 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.52 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  35.95 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  30.82 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  41.43 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  34.06 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  35.11 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  34.94 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  30.36 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  36.4 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  30.68 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  31.82 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1035  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  30.65 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  31.67 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  31.44 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  29.02 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  30.36 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>