More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10553 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 358 aa  728    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  55.21 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  53.98 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  43.63 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  40.65 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 353 aa  214  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  45.04 
 
 		 350 aa  208  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  44.68 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  37.31 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  36.48 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  38.26 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 352 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  34.81 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  37.67 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  33.61 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  35.62 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 375 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  37.23 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  36.28 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  35.26 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  35.58 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  35.63 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  36.12 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  37.02 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  35.76 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  35.82 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  36.23 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  38.81 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  36.79 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  35.82 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  36.02 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  37.07 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  35.87 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  32.75 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  33.85 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  35.6 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  35.6 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  33.85 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 367 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  35.28 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  36.45 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  34.74 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  40.14 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  40.07 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  35.45 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  35.47 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  35.88 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  37 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  35.84 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  36.58 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  34.25 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  34.47 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  33.63 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 591 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  36.93 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  36 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>