More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1514 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  732    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  49.29 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 366 aa  299  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 349 aa  272  8.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  45.12 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  40.13 
 
 		 361 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.82 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  40.31 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  38.02 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  38.65 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  38.91 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 370 aa  205  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.91 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  42.96 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  36.74 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  34.84 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 369 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.57 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  35.35 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.45 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.59 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  34.34 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  36.73 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  38.7 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  35.95 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  34.45 
 
 		 552 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  36.98 
 
 		 355 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  37.38 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  36.97 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  40.25 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  36.2 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  39.25 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.85 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  35.56 
 
 		 358 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 366 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  38.34 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  38 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  37.34 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  36.06 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  38.02 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  36.06 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  38.36 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>