More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2494 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2494  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 363 aa  729    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 363 aa  255  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.49 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  45.87 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  45.87 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 355 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  46.41 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0047  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  46.56 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  36.8 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  36.8 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.98 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  39.65 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  39.57 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 359 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  44.27 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 358 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  38 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  38 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.76 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  46.52 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 357 aa  236  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  47.72 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.31 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  39.69 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41.1 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  44.22 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.7 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.11 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  40.05 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  47.33 
 
 		 362 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  39.4 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  42.12 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  47.57 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  38.97 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  45.17 
 
 		 366 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  42.42 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>