256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02255 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  78.07 
 
 		 273 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  62.5 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  53.91 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  51.16 
 
 		 267 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  51.57 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  51.57 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  51.15 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  50.2 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  51.9 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  51.17 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  49.81 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  47.47 
 
 		 256 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  51.04 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  49.01 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  47.71 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  49.03 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  46.56 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  47.08 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  47.47 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  42.86 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  44.59 
 
 		 268 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  43.41 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  41.48 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  46.44 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  42.52 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  36.84 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  32.06 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  33.58 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  35.68 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  29.84 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  36.21 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.36 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  29.85 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.38 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.49 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.69 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.43 
 
 		 337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.32 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  31.56 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.7 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  31.18 
 
 		 413 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  32.34 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.22 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  27.59 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  34.27 
 
 		 376 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.77 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  26.39 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.21 
 
 		 373 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.47 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.47 
 
 		 374 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.47 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.47 
 
 		 401 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.47 
 
 		 401 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.23 
 
 		 386 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  27.78 
 
 		 385 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.13 
 
 		 374 aa  85.9  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  27.66 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.57 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.9 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  34.29 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.11 
 
 		 597 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  28.57 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.53 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  29.57 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  31.68 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  30.48 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  23.41 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.9 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  26.7 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  26.24 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  26.24 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  26.81 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  32.91 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  32.91 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  32.91 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.97 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  25.79 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  28.24 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  25.14 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  26.4 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  26.79 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  30.71 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  24.37 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.67 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  28.29 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  31.43 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>