More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0836 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 1282 aa  2541    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  95.16 
 
 		 1282 aa  2405    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  36.06 
 
 		 1302 aa  209  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  34.11 
 
 		 1519 aa  185  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 		 1421 aa  148  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  27.97 
 
 		 393 aa  134  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  27.14 
 
 		 420 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  25.57 
 
 		 711 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  26.05 
 
 		 944 aa  126  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  27.8 
 
 		 578 aa  125  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  27.71 
 
 		 682 aa  125  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  27.19 
 
 		 683 aa  124  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  27.14 
 
 		 422 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  27.02 
 
 		 688 aa  123  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  27 
 
 		 689 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  25.89 
 
 		 547 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 420 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  27.35 
 
 		 717 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  26.85 
 
 		 683 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  26.82 
 
 		 729 aa  121  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  26.73 
 
 		 683 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 420 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  26.5 
 
 		 683 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.48 
 
 		 635 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  25.91 
 
 		 699 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  25.91 
 
 		 683 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  26.5 
 
 		 683 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  26.56 
 
 		 682 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  25.87 
 
 		 636 aa  119  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  26.5 
 
 		 683 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  24.87 
 
 		 412 aa  119  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  24.87 
 
 		 412 aa  119  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.42 
 
 		 718 aa  118  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  25.59 
 
 		 712 aa  118  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  30.14 
 
 		 377 aa  118  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.76 
 
 		 684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  24.62 
 
 		 412 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  25.39 
 
 		 630 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  26.35 
 
 		 684 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.09 
 
 		 685 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  24.76 
 
 		 718 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  26.35 
 
 		 684 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  24.62 
 
 		 412 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  24.62 
 
 		 412 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  24.62 
 
 		 412 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  24.62 
 
 		 412 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  24.62 
 
 		 412 aa  115  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  25.88 
 
 		 684 aa  115  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  25.38 
 
 		 723 aa  114  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  25.06 
 
 		 710 aa  114  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.54 
 
 		 870 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25.64 
 
 		 580 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  23.44 
 
 		 433 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.54 
 
 		 894 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  24.21 
 
 		 704 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.34 
 
 		 706 aa  113  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  24.48 
 
 		 386 aa  113  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  25.54 
 
 		 657 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  24.44 
 
 		 808 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  30.18 
 
 		 987 aa  112  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  24.66 
 
 		 696 aa  111  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  24.76 
 
 		 692 aa  111  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  26.42 
 
 		 602 aa  111  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  24.66 
 
 		 696 aa  110  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  29.71 
 
 		 756 aa  110  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  24.22 
 
 		 710 aa  110  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  22.72 
 
 		 543 aa  110  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  28.57 
 
 		 389 aa  109  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  28.68 
 
 		 426 aa  110  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  22.08 
 
 		 543 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  25.23 
 
 		 682 aa  109  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  25.5 
 
 		 864 aa  109  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  23.22 
 
 		 543 aa  109  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 553 aa  109  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  25.65 
 
 		 711 aa  109  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  27.64 
 
 		 413 aa  108  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  23.5 
 
 		 462 aa  108  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  25.27 
 
 		 721 aa  108  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  23.5 
 
 		 462 aa  108  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  30.48 
 
 		 630 aa  108  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  23.5 
 
 		 462 aa  108  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  23.5 
 
 		 465 aa  108  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  28.31 
 
 		 426 aa  108  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.24 
 
 		 874 aa  108  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 553 aa  108  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  32.16 
 
 		 636 aa  108  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  28.26 
 
 		 426 aa  107  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  25.54 
 
 		 915 aa  107  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  23.5 
 
 		 527 aa  107  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  23.5 
 
 		 575 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  24.77 
 
 		 710 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  24.82 
 
 		 371 aa  106  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  24.4 
 
 		 716 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  23.25 
 
 		 576 aa  106  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  24.56 
 
 		 946 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  23.5 
 
 		 616 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  24.34 
 
 		 668 aa  105  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  24.84 
 
 		 715 aa  105  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  23.75 
 
 		 1269 aa  105  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  28.37 
 
 		 710 aa  104  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>