More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1390 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 533 aa  1071    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  64.08 
 
 		 539 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  64 
 
 		 531 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  63.33 
 
 		 546 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  64.08 
 
 		 539 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  72.47 
 
 		 587 aa  772    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  64.08 
 
 		 539 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  60.89 
 
 		 532 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  57.39 
 
 		 544 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.78 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  54.14 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  52.37 
 
 		 533 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.01 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.89 
 
 		 538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 		 566 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 567 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  52.24 
 
 		 550 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  49.37 
 
 		 560 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  50.85 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  50.64 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.64 
 
 		 543 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.35 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  48.46 
 
 		 563 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  50.47 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  46.6 
 
 		 593 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  48.82 
 
 		 544 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  48.58 
 
 		 571 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  50.54 
 
 		 634 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  49.25 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  50.46 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  47.33 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.82 
 
 		 554 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.01 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  45.57 
 
 		 609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  48.55 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  48.81 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  45.26 
 
 		 605 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.08 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 594 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.33 
 
 		 553 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.62 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  47.64 
 
 		 546 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.08 
 
 		 607 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  47.11 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  44.66 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  46.9 
 
 		 599 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.03 
 
 		 570 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  45.42 
 
 		 640 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  46.89 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  45.13 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  45.52 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  45.4 
 
 		 576 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.12 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.52 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  45.54 
 
 		 560 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  47.91 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.06 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  45.67 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.36 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.06 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  46.42 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  42.29 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  43.65 
 
 		 544 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  41.4 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  43.96 
 
 		 548 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.18 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  47 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.47 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 543 aa  342  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.33 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  40.62 
 
 		 543 aa  333  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.34 
 
 		 536 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  43.1 
 
 		 518 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.51 
 
 		 533 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.07 
 
 		 535 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.16 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  48.82 
 
 		 535 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.32 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.9 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  38.79 
 
 		 540 aa  327  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.76 
 
 		 735 aa  326  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.89 
 
 		 548 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.9 
 
 		 529 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  44.47 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  46.93 
 
 		 540 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.85 
 
 		 555 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  37.21 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.21 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.74 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  45.84 
 
 		 528 aa  319  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  37.45 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.3 
 
 		 547 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  37.14 
 
 		 548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.88 
 
 		 549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  37.17 
 
 		 540 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  37.99 
 
 		 540 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>