More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0418 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  346  8e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  80 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  59.46 
 
 		 585 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 855 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 845 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  62.5 
 
 		 378 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  56.41 
 
 		 276 aa  51.6  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  56.41 
 
 		 276 aa  51.6  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 1031 aa  51.2  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 286 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 866 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  90 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  28.81 
 
 		 731 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  80.95 
 
 		 432 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  72 
 
 		 291 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  67.86 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  85.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  77.27 
 
 		 309 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  89.47 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  85.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  85.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  85.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  85.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  72 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  72 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 922 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  27.12 
 
 		 731 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 1017 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 384 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  89.47 
 
 		 259 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  75 
 
 		 318 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  36.92 
 
 		 260 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 110 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 112 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 1029 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 857 aa  48.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  85 
 
 		 112 aa  48.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  73.91 
 
 		 297 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  85 
 
 		 420 aa  48.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 239 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 1277 aa  47.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 104 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 111 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  53.66 
 
 		 894 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  85.71 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  85.71 
 
 		 110 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  80.95 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  80.95 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 958 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 325 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 910 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  77.27 
 
 		 875 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  85 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 897 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 535 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 888 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 291 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  77.27 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 1118 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 859 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  80.95 
 
 		 253 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  38.81 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 1027 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 1024 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  62.86 
 
 		 869 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  69.57 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 909 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 800 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 421 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  50 
 
 		 314 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 921 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  76.19 
 
 		 110 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 903 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 836 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  60.61 
 
 		 457 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  66.67 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 912 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>