More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0706 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  100 
 
 		 314 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  76.15 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  70.8 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  70.8 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  66.79 
 
 		 278 aa  338  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  54.91 
 
 		 260 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  55.72 
 
 		 274 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  52.71 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  51.81 
 
 		 272 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  30.7 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  25.61 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  26.91 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  26.91 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  27.38 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  26.33 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  28.46 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  28.82 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  36.89 
 
 		 844 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 944 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 962 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  28.08 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 		 962 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 962 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  28.2 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  27.38 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  27.38 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  25.37 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.69 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  84.62 
 
 		 843 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  84.62 
 
 		 843 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  27.51 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 907 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  27.31 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 897 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  24.68 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 907 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  54.29 
 
 		 907 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  25.57 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 842 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 848 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 899 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 		 907 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 917 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 907 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  60.61 
 
 		 908 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 908 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 908 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 908 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 993 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 911 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 906 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 945 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1118 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 920 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 845 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 865 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 		 909 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 908 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 908 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 908 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 908 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 896 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 908 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 919 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  43.75 
 
 		 163 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  54.05 
 
 		 992 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 902 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 932 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 932 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 932 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 1067 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 915 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 932 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  33.09 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  44.83 
 
 		 1102 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  71.43 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  58.33 
 
 		 955 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 904 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 934 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1024 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 834 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 904 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 924 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 923 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 909 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 917 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 930 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 932 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  45.1 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 904 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 906 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 922 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>