176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4482 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  80.22 
 
 		 272 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  60.93 
 
 		 283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  57.88 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  58.99 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  59.92 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  56.68 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  56.68 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  55.72 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  34.62 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  27.73 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  27.73 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  29.41 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  26.84 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  27.69 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  21.83 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  28.98 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  58.14 
 
 		 1102 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  25 
 
 		 432 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 1027 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 		 962 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 962 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 962 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 944 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  70.59 
 
 		 872 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  51.02 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  31.02 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  26.27 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  26.69 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  67.65 
 
 		 896 aa  48.9  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  61.76 
 
 		 970 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 1024 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  68.97 
 
 		 993 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 899 aa  48.5  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  25.91 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  31.54 
 
 		 1200 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 920 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25.91 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 934 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  81.82 
 
 		 955 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 1004 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25.91 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  52.94 
 
 		 837 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  67.74 
 
 		 1067 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 1031 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 1024 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 913 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 888 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  70.37 
 
 		 420 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3880  hypothetical protein  68 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0869026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  60.71 
 
 		 913 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  85 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 912 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  60.61 
 
 		 923 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 980 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 912 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  85 
 
 		 945 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 908 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 939 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 1024 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4023  SEC-C motif domain protein  64 
 
 		 133 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 111 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 908 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 907 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 909 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  85 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  45.45 
 
 		 535 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  80 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 896 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 896 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 1017 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  84.21 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 903 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  84.21 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  71.43 
 
 		 110 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  65.62 
 
 		 912 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  64.52 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  53.49 
 
 		 830 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 916 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 915 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 922 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  84.21 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 916 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 907 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 1029 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  50.98 
 
 		 835 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 896 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 906 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 833 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  52.83 
 
 		 836 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  84.21 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 909 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3986  SEC-C motif domain protein  48.89 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 901 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  58.82 
 
 		 925 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>