More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1266 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  42.96 
 
 
968 aa  728    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  39.13 
 
 
915 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  80.25 
 
 
1024 aa  1705    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  46.98 
 
 
1113 aa  983    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  40.36 
 
 
902 aa  708    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  42.55 
 
 
867 aa  713    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  38.76 
 
 
913 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  39.06 
 
 
913 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.27 
 
 
939 aa  703    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.21 
 
 
1136 aa  1050    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  47.6 
 
 
1117 aa  890    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  72.59 
 
 
1029 aa  1535    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  39.36 
 
 
909 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  78.3 
 
 
1024 aa  1659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  77.35 
 
 
1017 aa  1617    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  38.03 
 
 
1024 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  48.35 
 
 
1120 aa  970    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.37 
 
 
1010 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  38.39 
 
 
913 aa  665    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  47.94 
 
 
1004 aa  909    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  40.37 
 
 
890 aa  664    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  49.61 
 
 
1130 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  38.88 
 
 
909 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 
930 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  46.62 
 
 
1117 aa  939    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  46.74 
 
 
1116 aa  892    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  48.11 
 
 
1118 aa  942    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  39 
 
 
907 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  50.18 
 
 
1102 aa  1037    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  49.42 
 
 
1114 aa  941    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  49.64 
 
 
1118 aa  1012    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  73.16 
 
 
1031 aa  1540    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  38.61 
 
 
911 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  38.28 
 
 
907 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  49.62 
 
 
1114 aa  963    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  39.33 
 
 
914 aa  686    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  38.39 
 
 
916 aa  665    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
1022 aa  2100    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  82.85 
 
 
1027 aa  1730    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  40.9 
 
 
897 aa  719    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  37.92 
 
 
925 aa  654    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  36.52 
 
 
1032 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  35.87 
 
 
911 aa  611  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  38.61 
 
 
865 aa  592  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.18 
 
 
859 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  48.75 
 
 
833 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  45.93 
 
 
830 aa  556  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  50.09 
 
 
864 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  44.51 
 
 
886 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  44.76 
 
 
845 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  45.58 
 
 
848 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  43.05 
 
 
897 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  46.11 
 
 
834 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 
858 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  44.49 
 
 
900 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  47.61 
 
 
844 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  44.56 
 
 
836 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.08 
 
 
908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 
862 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  48.67 
 
 
899 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  38.77 
 
 
904 aa  538  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  44 
 
 
907 aa  538  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  48.34 
 
 
884 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  44.79 
 
 
840 aa  539  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.91 
 
 
836 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 
862 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  43.28 
 
 
925 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  47.53 
 
 
896 aa  535  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  48.17 
 
 
863 aa  536  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  46.33 
 
 
838 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  44.14 
 
 
837 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  50.44 
 
 
858 aa  535  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  47.41 
 
 
862 aa  535  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  44.05 
 
 
916 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  48.75 
 
 
896 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 
872 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  47.42 
 
 
881 aa  531  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  47.15 
 
 
894 aa  532  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  43.95 
 
 
901 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 
910 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  43.95 
 
 
901 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  43.95 
 
 
901 aa  532  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  42.4 
 
 
896 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  43.95 
 
 
901 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 
840 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  44.65 
 
 
845 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  41.3 
 
 
908 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  43.95 
 
 
901 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  43.47 
 
 
908 aa  528  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  47.52 
 
 
899 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
901 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  43.97 
 
 
901 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  41.89 
 
 
908 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 
901 aa  529  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>