More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1677 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  47.39 
 
 		 1024 aa  891    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  46.31 
 
 		 968 aa  811    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 		 911 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 1113 aa  834    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  41.59 
 
 		 1130 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.11 
 
 		 939 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  38.18 
 
 		 913 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  42.87 
 
 		 1136 aa  801    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  38.65 
 
 		 913 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  55.02 
 
 		 1117 aa  1026    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  42.16 
 
 		 1102 aa  825    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  37.92 
 
 		 934 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  40.63 
 
 		 903 aa  680    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  46.57 
 
 		 1024 aa  887    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  45.58 
 
 		 1017 aa  864    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  41.62 
 
 		 1114 aa  778    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  39.37 
 
 		 921 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  38.02 
 
 		 911 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  40.14 
 
 		 1114 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  47.12 
 
 		 1031 aa  879    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  41.02 
 
 		 930 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  47.29 
 
 		 1116 aa  725    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  47.17 
 
 		 1027 aa  898    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  43.01 
 
 		 1118 aa  773    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  43.95 
 
 		 1118 aa  834    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 		 939 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  47.23 
 
 		 1029 aa  897    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  42.72 
 
 		 1120 aa  790    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  38.21 
 
 		 911 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1004 aa  2074    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  48.39 
 
 		 1022 aa  910    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  40.83 
 
 		 1117 aa  753    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  47.55 
 
 		 864 aa  539  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.47 
 
 		 859 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  46.09 
 
 		 907 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.5 
 
 		 906 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  45.81 
 
 		 922 aa  517  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  47.2 
 
 		 837 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  49.74 
 
 		 833 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  47.88 
 
 		 837 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  45.03 
 
 		 907 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.1 
 
 		 886 aa  515  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 908 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  45.64 
 
 		 902 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 907 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  44.39 
 
 		 907 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  41.49 
 
 		 893 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 		 908 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  44.41 
 
 		 907 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  44.44 
 
 		 834 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 		 909 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 909 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  48.12 
 
 		 848 aa  505  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  48.14 
 
 		 844 aa  505  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  44.39 
 
 		 903 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  42.73 
 
 		 962 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  42.15 
 
 		 906 aa  505  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  45.67 
 
 		 838 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  45.07 
 
 		 896 aa  502  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.59 
 
 		 962 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 908 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.46 
 
 		 908 aa  502  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 911 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 		 908 aa  503  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 		 908 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 908 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 		 908 aa  503  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  43.41 
 
 		 845 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.59 
 
 		 962 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  45.5 
 
 		 836 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  44.24 
 
 		 844 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  43.93 
 
 		 939 aa  499  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  43.89 
 
 		 914 aa  499  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  43.89 
 
 		 914 aa  499  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  44 
 
 		 912 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  46.83 
 
 		 840 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  44.57 
 
 		 914 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  44.67 
 
 		 909 aa  495  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  44.44 
 
 		 908 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.2 
 
 		 858 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  43.11 
 
 		 894 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.48 
 
 		 842 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  44.16 
 
 		 925 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  45.33 
 
 		 835 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.36 
 
 		 836 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  45.33 
 
 		 835 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 		 910 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  43.1 
 
 		 896 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3982  preprotein translocase SECA subunit  41.18 
 
 		 899 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  43.43 
 
 		 881 aa  492  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  42.99 
 
 		 911 aa  493  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  43.46 
 
 		 845 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  45.67 
 
 		 835 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  45.6 
 
 		 868 aa  491  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  43.81 
 
 		 906 aa  492  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  42.84 
 
 		 866 aa  490  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 910 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  42.13 
 
 		 911 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  45.5 
 
 		 858 aa  489  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  42.97 
 
 		 907 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>